Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms