Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms