Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms