Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp10aO54827 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms