Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek2O35942 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms