Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms