Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms