Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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TnxbO35452 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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