Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms