Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Scarb2O35114 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Scarb2O35114 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Scarb2O35114 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Scarb2O35114 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms