Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EllO08856 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EllO08856 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EllO08856 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EllO08856 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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