Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn5O08688 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn5O08688 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn5O08688 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn5O08688 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn5O08688 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn5O08688 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms