Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm3239L7N2D9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3239L7N2D9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3239L7N2D9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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