Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm20878L7N244 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20878L7N244 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20878L7N244 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20878L7N244 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20878L7N244 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20878L7N244 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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