Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r88L7N1W8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r88L7N1W8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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