Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20795J3QP49 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20795J3QP49 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20795J3QP49 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20795J3QP49 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20795J3QP49 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Gm20795J3QP49 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20795J3QP49 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20795J3QP49 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20795J3QP49 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20795J3QP49 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20795J3QP49 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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