Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm21797J3QNW5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21797J3QNW5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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