Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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