Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930544D05RikJ3QK56 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms