Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4cI6XKQ3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms