Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm29394H3BIW7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29394H3BIW7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms