Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Taf4bG5E8Z2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Taf4bG5E8Z2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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