Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms