Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r58G3X9U3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms