Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28374F6SG70 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms