Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms