Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf165E9QAU8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms