Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms