Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms