Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms