Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Arhgef5E9Q7D5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgef5E9Q7D5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms