Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Usp31E9Q6Y8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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