Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6S4

Gm17067, Predicted gene 17067, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17067E9Q6S4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17067E9Q6S4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17067E9Q6S4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17067E9Q6S4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms