Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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