Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms