Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm3095E9Q058 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3095E9Q058 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3095E9Q058 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3095E9Q058 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3095E9Q058 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3095E9Q058 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms