Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms