Protein–RNA interactions for Protein: E9PVW1

Zkscan7, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 7, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan7E9PVW1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan7E9PVW1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zkscan7E9PVW1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms