Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms