Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms