Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms