Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC048679D3YXE9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC048679D3YXE9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC048679D3YXE9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC048679D3YXE9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC048679D3YXE9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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