Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rexo5D3YW29 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms