Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3259D3YUK0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms