Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6133B2RY53 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms