Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms