Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cped1B2RX70 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms