Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms