Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms