Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms